食源性疫情调查强制采用全基因组测序
自 2026 年 8 月 23 日起，欧盟成员国必须对五种食源性病原体的分离株进行基因组测序。对微生物实验室而言，默认方法由血清分型转为测序。
- 自 2026 年 8 月 23 日起，全基因组测序不再是血清分型的补充，而是强制要求。
- 涵盖五种病原体：沙门氏菌、单核细胞增生李斯特菌、大肠杆菌以及空肠弯曲菌和结肠弯曲菌。
- 人源分离株与来自食品、饲料和动物的分离株均须上报，数据提交至 EFSA 与 ECDC 联合系统。
- 基因组可判定样品菌株与病人菌株是否为同一克隆；血清型只能指出所属大类。
- 实验室需要测序能力、能判断读长质量的人员，以及可纳入认可范围的程序。菌株须留存以备重新测序。
- 生产企业会间接受到影响：把生产环境中的菌株与病人分离株比对将成为常规。
来源: EFSA